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      新聞詳情

      阿爾茨海默癥行為學“金標準”— 水迷宮之統計分析篇

      日期:2022-05-20 05:54
      瀏覽次數:1113
      摘要:摘要:水迷宮可統計的項目非常多,表征的記憶指標也十分豐富,廢話不多說,容我逐一道來。這里以Jove上一篇文章中的結果作為例子,分組(具體什么轉基因小鼠就不說了),前三個很常規,分別是對照組(陽性對照),AD組(陰性對照)和用藥組,還有MA(Manual Acupuncture)組是針灸組,這個實驗目的大概是看看針灸是不是能達到用藥的效果。

      水迷宮可統計的項目非常多,表征的記憶指標也十分豐富,廢話不多說,容我逐一道來。

      這里以Jove上一篇文章中的結果作為例子,分組(具體什么轉基因小鼠就不說了),前三個很常規,分別是對照組(陽性對照),AD組(陰性對照)和用藥組,還有MA(Manual Acupuncture)組是針灸組,這個實驗目的大概是看看針灸是不是能達到用藥的效果。

      圖1. 水迷宮數據統計舉例[1] 

      上圖是水迷宮實驗的標準展示方法,A圖是平臺可見期的找到平臺的時間和游泳速度;B圖展示的是動物學習找到平臺的能力;C圖是比較各個組跨越平臺的次數和在原平臺區域滯留的時間百分比。在上圖的基礎上我們再補充一些其他的可檢測項目就得到了下表:

      圖2. 水迷宮統計數據匯總

      01 可見平臺期實驗中需要統計的數據包括:

      ? 從放小鼠入水到小鼠爬上平臺所需時間(較重要,這個主要是檢測動物的運動能力)

      ? 從放小鼠入水到小鼠爬上平臺的路徑長度(較重要,檢測動物尋找平臺的策略,特別是檢測老年小鼠是否視力有問題)

      ? 小鼠游泳的游泳速度(重要,由前面兩個數據相除得到)

      需要關注的行為(用于排除部分無用小鼠數據):

      ? 小鼠漂浮不動的時間和次數

      ? 小鼠是否會爬上平臺后跳下來

      ? 小鼠是否圍繞水池邊緣游泳并試圖攀爬

      02 隱藏平臺實驗中需要統計的數據包括:

      ? 從放小鼠入水到小鼠爬上平臺所需時間(*重要,*核心的數據,因為有分組和時間兩個維度,需要用到Two-Way Anova進行統計)

      ? 從放小鼠入水到小鼠爬上平臺的路徑長度(同樣也是動物的搜索策略問題)

      ? 小鼠游泳的游泳速度(同可見平臺期)

      ? 在整個過程中小鼠與平臺中心的距離之和(另一種判斷學習能力的方法,比較少見)

      ? 小鼠剛入水后的**次向中心游動時的方向與起點-平臺直線的夾角(這個就更少了)

      在這里可以根據前人的研究發現,水迷宮平臺隱藏期的尋找平臺的所需時間、路徑長度以及與平臺的距離三者之間是高度相關的。而**游動方向則與前三者相關性較弱,因此一般我們在文章中*多只需要列出前三個數據就可以說明問題了。

      圖3. 平臺隱藏期數據相關性[2] 

      03 無平臺探索期實驗中所需統計的數據:

      ? 小鼠在每個象限停留的時間

      ? 小鼠在每個象限的路徑長度

      ? 小鼠與原平臺位置的平均距離

      ? 小鼠**次到達原平臺位置的時間和路徑長度

      ? 小鼠穿過原平臺位置的次數

      需要提醒同學們注意的是,像隱藏平臺期的實驗,首先每只小鼠每天有n個Trials,而每個分組又有m只動物,在這里,我們一般會將每只小鼠的當天的n個Trial取平均值,然后再用這個平均值加入到該分組小鼠的當天數據統計之中,于是一組動物就獲得了一個帶誤差線的數據點。但這其實是損失了不少信息的。舉個例子,如果一只動物在連續幾天的Trials中都表現為**個Trial尋找平臺困難,而在當天接下來的Trails中卻很快學會尋找平臺,那么有可能這只動物存在長期記憶的問題,但是短期記憶保持完好,如果我們只統計當天的平均值,那么這個信息就丟失了。所以除了數據統計分析以外,細心的觀察也是很重要的。

      大至上水迷宮統計的數據就是以上這些,其實*關鍵的還是視頻拍攝效果的到位,和分析軟件功能的完善,其實前者更重要,分析軟件的話比較有名的有Ethovision XT和Any-Maze,其余像Smart,AniLab以及上海欣軟開發的也都不錯。

      來源:賽業生物

      滬公網安備 31011302004470號

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